崇祯三年（1630年）八月，袁崇焕被凌迟三千多刀而死，抄没家产，家人被流放三千里。史学界有这样一个说法，崇祯是中了皇太极的离间计，误杀了袁崇焕，这是自毁长城的举动。
《明史·袁崇焕传》中记载，当皇太极所部出现在北京城附近时，谣言四起，“然都人骤遭兵，怨谤纷起，谓崇焕纵敌拥兵。”做一个假设，当皇太极兵临北京城时，你正在城内溜达，突然全城戒严了。
一打听才知道皇太极打来了，你心里肯定在惶恐，袁崇焕那么厉害，由他镇守辽东，皇太极怎么可能打到北京城下？你第一反应可能想到的是袁崇焕兵败了，没过几天你又听说袁崇焕也出现在北京城外。
就在这时，左邻右舍都在流传一个谣言，是袁崇焕通敌把皇太极放进来了。又过了几天，袁崇焕被下狱了，你更加相信谣言原来是真的，于是加入声讨袁崇焕的队伍中，在他被押往刑场的路上向他扔烂菜叶、臭鸡蛋等等。
上面的说法看似无懈可击，实则忽视了一个大漏洞。因为袁崇焕被下狱，到最终被凌迟，中间间隔有10个月，崇祯就是中了皇太极的离间计也能清醒过来。袁崇焕被杀其实另有玄机，综合来说有两个方面：一是吹嘘五年复辽未能实现；二是擅杀毛文龙。
五年平辽，袁崇焕也真敢吹，把崇祯刺激地万分激动。给事中许誉卿头脑稍微清醒，当袁崇焕吹嘘完后询问平辽具体方案时，袁崇焕却说自己只是说说而已，宽慰皇帝罢了。这就尴尬了，把皇帝当三岁小孩耍？
要知道君无戏言，崇祯信以为真，还授予袁崇焕先斩后奏之权。这是皇帝对你的最高信任，可不是说你袁崇焕就可以胡搞。吹嘘“五年平辽”的目标后，袁崇焕骑虎难下。稍微分析下，谁都知道“五年平辽”根本不能，但崇祯却报以极大的期待。
袁崇焕擅杀毛文龙，触动了崇祯，毛文龙再不堪，也不是袁崇焕说杀就杀的。在崇祯看来，当时最大的威胁不在外而在内，在于类似袁崇焕这样手握重兵的将领。从勤勉程度上来说，崇祯是一个勤政皇帝，在位17年确实想一番作为。
然而，崇祯一次次的期待，换来的却是一次次的失望。袁崇焕终究五年未能复辽，反而还让皇太极打到了北京城下，崇祯彻底绝望了。内忧外患，又渴望振兴大明，让平庸的崇祯精神几乎崩溃。
按照《明史》中的记载，袁崇焕被杀的罪行有三：主和议、擅杀大帅、谋叛。任何一个罪行都是诛灭九族的大罪，可见崇祯已经下了决心要诛杀袁崇焕。
参考资料：《明史·袁崇焕传》、《明季北略》